電影《牡丹仙子之皇帝詔曰》講述的是“天下第一牡丹”的故事。冬日，武則天下旨要百花開放，看護牡丹的花女瑞玉（袁菲飾），執意守護花期，不肯讓牡丹違時開放，被武則天貶往洛陽。流放途中，瑞玉無意得到武承嗣謀反證據，而被武三（郭豐周飾）一路追殺。途徑古縣時，又遇瘟疫肆虐，民不聊生。瑞玉勸說押送官兵能稍作停留，爲百姓治病。同時，狄仁傑得知證據去向，派出侍衛唐大成（黃榛飾）暗中保護瑞玉（袁菲飾），貧瘠的古縣城即將掀起一場血雨腥風……