神祕組織·GOD看中了神敬太郎博士的人類工學技術，逼迫其加入，教授拒絕而遭襲擊，兒子神敬介也被殺害，身受重傷的父親爲了讓兒子復活，不顧自己的傷勢，親自執刀爲兒子進行改造手術。敬介醒來後，父親已死，透過計算機留言，敬介瞭解GOD欲危害世界的陰謀，於是揹負起對抗邪惡的責任，成爲第五號的假面騎士·假面騎士X。