大金剛在軍警圍捕之下，終於從帝國下廈摔下受重傷，十年後，在喬治亞洲特蘭大大學醫療研究，有機會再度復活。爲此研發人工心臟，準備爲她做換心手術，但要量同類的血液。正當大家一籌莫展時，米奇意外地抓到另一隻母猿，並賣給政府以便進行手術，艾咪爲此手術執刀，不料手術後的大金剛與母原從回原生地，逃開人類的控制，而被軍隊重重包圍，大金剛被炮擊而身受重傷。母猿亦在這次攻擊受捕，爲展開營救母猿、大金剛將再次肆虐人類……